新HPCの歩み（第300回）－2010年(h)－

東京と京都でPCクラスタコンソーシアムのe-Scienceチュートリアルが行われ、開発されたツールが紹介された。東大では、科研費による第2回 自動チューニング技術の現状と応用に関するシンポジウム」が開催された。

13:00-13:10

ご挨拶

13:10-14:00

「日本のバイオインフォマティックスの問題点と対策 IT、バイオ、健康、医療をマージさせるには？」

理化学研究所ゲノム医科学研究センター長　鎌谷 直之

14:00-14:50

沖縄科学技術研究基盤整備機構ミラー　ジョナサン

14:50-15:10

休憩

15:10-16:00

「The custom service provider for Genome analysis by Next-generation sequencers」

タカラバイオ株式会社　北川 正成

16:00-16:50

「Infrastructure for Development of Codes in Scientific Computing on Post-Peta-Scale Systems」

東京大学情報基盤センター中島 研吾

16:50-17:10

休憩

17:10-18:00

パネルディスカッション

「次世代シーケンサ　何が問題か？バイオインフォマティクスの視点から」

18:30-20:00

懇親会

9:20 -9:30

主催者挨拶

9:30 -10:30

【基調講演】GPU Computing will Fundamentally Change Science

David Kirk (NVIDIA)

10:30-10:55

GPGPUによる量子化学計算の高速化

古賀良太*, 古川祐貴*, 安田耕二**（(株)クロスアビリティ*, 名大**）

10:55-11:20

GPUによる3D-RISMプログラムの高速化

丸山豊、平田文男（分子科学研究所）

11:20-11:45

3次元画像計測分野でのGPUを用いた高速化事例

関口 尚大（東杜シーテック(株)）

11:45-12:10

GPGPU for Microsoft Excel ～金融・デリバティブ計算 への適用事例

松尾拓真, 鳥居秀行（ニューメリカルテクノロジーズ）

12:10-13:30

昼休み

13:30-13:55

ステンシル計算を対象とした大規模GPUクラスタ向け自動並列化

野村達雄, 丸山直也, 松岡聡（東工大）

13:55-14:20

Expression Templateを使ったベクトル演算のCUDAによる実装と評価

二田　晴彦（みずほ情報総研）

14:20-14:45

大規模有限要素解析システムADVENTUREのGPUへの移植

河合浩志, 荻野正雄, 塩谷隆二, 吉村忍（東大）

14:45-15:10

CUDA＋OpenGLを用いたGPU-FDTDによる3次元音響シミュレー ションと高速可視化

大久保寛（首都大）

15:10-15:35

マルチGPUによる電磁界解析の高速化

村山敏夫（ソニー(株)）

15:35-16:00　

　（休憩）

16:00-16:25

数値流体解析の並列効率とそのGPUによる高速化の試み

PHAM VAN PHUC（清水建設(株)）

16:25-16:50

GPUへのコンパクト差分の実装と圧縮性流体計算への適用

出川智啓（電通大）

16:50-17:15

複数 GPU による大規模 LES 乱流計算

小野寺直幸*，青木尊之*，小林宏充**（東工大*，慶大**）

17:15-17:40

粒子法のFermiへの実装とその性能評価

藤澤智光（プロメテック(株)）

18:00-20:00

（懇親会）　

13:30

概要

實本　英之（東京大学）

13:45

Catwalk

堀　敦史（東京大学）

14:15

MPI-Adapter

住元　真司（富士通研究所）

14:45

xqsub

山本 啓二（東京大学）

15:15

BRAKE（ママ）

15:30

Xabclib

片桐　孝洋（東京大学）、黒田　久泰（愛媛大学）

16:10

Xcrypt

平石　拓（京都大学）

16:50

XcalableMP

中尾　昌広（筑波大学）

「エネルギーマネジメントセンサーネットワークによるGreen by IT」

西宏章（慶応義塾大）

「Network RFIDとInternet of Things」

三次仁（慶応義塾大）

9:55-10:00

ご挨拶

研究代表者：姫野龍太郎（理化学研究所 情報基盤センター）

10:00-10:30

形状一次・変数二次サブパラメトリック辺要素有限要素法による磁界解析

岡本吉史（宇都宮大学 大学院工学研究科）

10:30-11:00

マルチコア・マルチプラットフォーム環境での固有値アルゴリズム

今村俊幸（電気通信大学 電気通信学部）

11:00-11:30

密行列対称固有値ソルバABCLib_DRSSEDにおける超並列向きデータ分散法～枢軸ベクトル重複所有と実行速度のトレードオフ～

片桐孝洋（東京大学 情報基盤センター）

13:00-13:30

CG法の前処理 再考

藤野清次（九州大学 情報基盤研究開発センター）

13:30-14:00

線形方程式ソルバGPBiCG（一般化積型共役勾配）法の改良について

阿部邦美（岐阜聖徳学園大学 経済情報学部）

14:20-14:50

線形計算アルゴリズムに対する体系的性能評価の品質管理としての側面

伊藤祥司（東京大学 情報基盤センター）

14:50-15:20

高精度線形代数ライブラリの半正定値計画への応用

中田真秀（理化学研究所 情報基盤センター）

15:20-15:50

スーパーコンピュータ運用効率化のためのジョブスケジューラの研究

伊藤利佳（宇宙航空研究開発機構）

16:10-16:40

アプリケーションミドルウェアSPHEREの開発

伊東　聰（理化学研究所 次世代計算科学研究開発プログラム），

小野謙二（理化学研究所 機能情報シミュレーションチーム）

16:40-17:10

ペタスケール時代に必要となるミドルウェア開発への期待

姫野龍太郎（理化学研究所 情報基盤センター）

17:30～

懇親会　　　　　　　

13:30-13:40

「ものづくりと防災を支える次世代スーパーコンピュータ」

工学院大学情報学部　小柳義夫

13:40-14:20

「世界最速レベルを目指す次世代スーパーコンピュータ開発」

理化学研究所、次世代スーパーコンピュータ開発実施本部 横川三津夫

14:20-15:00

「スーパーコンピュータによる自動車用次世代空力シミュレータ」

北海道大学工学研究院 坪倉誠

15:00-15:40

「次世代スーパーコンピュータで挑む、巨大地震の揺れと津波の予測、災害軽減」

東京大学地震研　古村孝志

10:00-10:10

科研費による自動チューニング研究の取り組み

東京大学　須田礼仁

10:10-10:30

自動チューニング記述言語の進展

東京大学　片桐孝洋

10:30-10:50

複合マルチコア環境のための自動チューニング技術

電気通信大学　今村俊幸

11:00-11:45

【招待講演】精度保証付き数値計算のスケーラビリティを保ったチューニング

早稲田大学　大石進一

13:15-14:00

【招待講演】高性能計算ライブラリ開発の実状

(株) 富士通研究所　 成瀬彰

14:15-14:35

複合型計算システムにおける実行時自動チューニング

東北大学　滝沢寛之

14:35-14:55

安全な計算状態操作機構のこれまでと今後

京都大学　八杉昌宏

15:10-15:30

高ユーザビリティを目指す大規模並列シミュレータの開発インフラ SPHERE

理化学研究所　小野謙二

15:30-15:50

自動チューニング数理基盤ライブラリ

東京大学　須田礼仁

15:50-16:50

討論：「ポストペタ時代のソフトウェア技術」

司会： 須田礼仁（東京大学）　パネリスト： 中島研吾（東京大学）  八杉昌宏（京都大学），山本有作（神戸大学）， 高橋大介（筑波大学）

16:50-17:00

科研費による自動チューニング研究の今後の展開

東京大学　片桐孝洋

10:00-11:30

Condorチュートリアル

11:30-13:00

昼食

13:00-13:10

ご挨拶

13:10-14:00

Condor Overview and Roadmap

Miron Livny, Univ of Wisconsin

14:00-14:30

Case Study-1 “Honda Grid System: Increasing Calculation Performance at a Reasonable Price with Condor”

セシル　ガロス（アルゴグラフィックス）、

前川　史人（本田技術研究所）

14:30-15:00

Case Study-2 “Ez-Grid: グリッド自動運転システム”

西　克也（ベストシステムズ）

15:00-15:30

休憩

15:30-16:00

Case Study-3　”Condor VM ユニバースを利用した HPC Cloud の試作と評価”

二木　邦尚（アルゴグラフィックス）

16:00-16:30

Case Study-4

16:30-17:30

Condor Issues and Future – Open Discussion

17:30-19:00

懇親会

13:00

『3度目の正直なるか3D映像』　　　　　　　　　　　　

前川　秀正（みずほ情報総研(株)）

14:30

休憩

14:45

『日立における3Dディスプレイへの取り組み』

小池　崇文（日立製作所　システム開発研究所）

16:15

デモ：フルパララックス3Dディスプレイ

【(株)日立製作所　システム開発研究所】

10:30

開会のご挨拶

秋山　泰（IPAB理事長）

10:40

「京速コンピュータ「京」の概要とその利用について」

庄司文由（理化学研究所）

11:25

Dealing with Large-Scale Genomic Data: Open Data Infrastructure and Workflow Solutions for Genomics Research

Robert Triendl (DDN Japan)

12:10

昼食

13:30

FPGAによるバイオインフォマティクスのアクセラレーション

天野英晴（慶応義塾大学）

14:15

低侵襲高精度診断治療のための高速三次元画像処理技術開発

廖洪恩（東京大學）

15:00

コーヒーブレイク

15:20

ゲノム情報の効率的な産業利用技術の開発

町田雅之（産業技術総合研究所）

16:05

分子動力学専用計算機mdgrape3を使用した化合物スクリーニング

沖本憲明（理化学研究所）

16:50

ブレイク

17:00

企業発表

17:45

閉会挨拶

18:00

レセプション

13:30

京速コンピュータ「京」の最新状況

黒川　原佳（理化学研究所）

14:00

大規模格子QCDシミュレーションで探る10^-13cmの世界

蔵増　嘉伸（理化学研究所）

14:30

次世代分子理論の開発と展開

中嶋　隆人（理化学研究所）

15:00

ブレーク

15:30

パネル討論「大規模アプリの開発環境はこう在りたい！」

司会：中島　浩（京都大学）

パネリスト：黒川　原佳（理化学研究所AICS 運用技術部）、蔵増　嘉伸（理化学研究所AICS連続系場の理論研究チーム）、中嶋　隆人（理化学研究所AICS量子系分子科学研究チーム）、中島　研吾(東京大学)

10:00

PCクラスタコンソーシアム10年の歩み

石川 裕（PCクラスタコンソーシアム会長/東京大学）

10:20

グリーンなスパコンはエクサスケールの夢を見るか。- TSUBAME2.0を例にして –

松岡　聡（東京工業大学）

11:00

HPC向け次世代Intelプロセッサ/ツールの紹介 発表資料

池井　満（インテル株式会社）

11:30

AMD Opteron(TM)プラットフォームの最新情報

林　淳二（日本AMD株式会社）

12:00

昼休み

13:30

中国のHPC事情（仮題）【英日同時通訳有】

Dr. Xuebin Chi (Supercomputing Center Chinese Academy of Sciences)

14:10

HPC Status in Korea【英日同時通訳有】

Dr. Jysoo Lee (Supercomputing Center at KISTI)

14:50

ブレーク

15:30

企業発表

「Gfarm商品版のご紹介」

株式会社ベストシステムズ　江波　均

「DDNストレージシステムのご紹介」

住商情報システム株式会社　小林　裕之

「富士通のPCクラスタへの取り組み」

富士通株式会社　久門　耕一

「日立のテクニカルコンピューティングへの取り組み」

株式会社日立製作所　清水　正明

「NECのHPCへの取り組み　～HPCクラスタソリューションのご紹介～」

日本電気株式会社　陶　理恵

17:10

クロージング

17:30

10周年記念レセプション