HPCの歩み50年(第151回)-2008年(d)-
SWoPPは再び佐賀県で開催されたが、「EXA-FLOPS スーパーコンピュータの実現を目指して」というBoFが開かれた。全国共同利用施設であるスーパーコンピュータを有する7大学は産業利用への取り組みを強化している。東北大学では9th Teraflop Workshopが開催された。

国内会議(続き)
12) SWoPP 2008
第21回目となるSWoPP佐賀2008(2008年並列/分散/協調処理に関する『佐賀』サマー・ワークショップ)は、2008年8月5日~7日に、佐賀市天神どんどんどんの森内のアバンセで開催された。主催は、電子情報通信学会コンピュータシステム研究会(CPSY)とディペンダブルコンピューティング研究会(DC)、情報処理学会計算機アーキテクチャ研究会(ARC)、プログラミング研究会(PRO)、ハイパフォーマンスコンピューティング研究会(HPC)、システムソフトウェアとオペレーティング・システム研究会(OS)、システム評価研究会(EVA)、および日本応用数理学会「行列・固有値問題の解法とその応用」研究部会(MEPA)である。通常の研究発表の他に、3件のBOF (Birds-of-a-Feather)セッションが行われた。
EXA-FLOPS スーパーコンピュータの実現を目指して | 姫野龍太郎(理化学研究所) |
パネル討論会:SWoPP の昨日・今日・明日 | モデレータ:朴泰祐(筑波大学) |
ここがグレイト!こんなに使える私の研究 | 代表者:吉瀬謙二(東京工業大学) |
13) 高精度・多倍長計算に関するフォーラム
SWoPP佐賀2008に引き続き、2008年8月8日に九州大学情報基盤センターにおいて「先駆的科学計算に関するフォーラム2008 (Forum on Advanced Scientific Computing 2008) ~高精度・多倍長計算~」が開催された。プログラムは以下の通り。
10:30 | 渡部 善隆 (九州大学) | 科学技術計算の品質保証 |
10:45 | 田邉 道徳(福井大学)他 | Web上での8倍精度数値計算システムの構築と数値積分の例 |
11:15 | 西田 晃 (九州大学) | 混合精度型反復解法の提案 |
11:45 | 昼食 | |
13:15 | 池井 満 (インテル) | Intel Advanced Vector Extensions (Intel AVX) 性能と 効率改善の最先端技術 |
13:45 | 濱口 信行 (日立製作所) | SR11000での多倍長演算使用例 |
14:15 | 休憩 | |
14:30 | 藤原 宏志 (京都大学) | PCクラスタでの多倍長計算の実装と利用 |
15:00 | 松田 望 (電気通信大学) | 多倍長演算と精度保証付き数値計算 |
15:30 | 休憩 | |
15:45 | 湯浅 富久(KEK)他 | 素粒子物理における多倍長計算 |
16:15 | 伊藤 衡平 (九州大学) | ボルツマン輸送方程式による金属内電気・熱輸送の数値解析 |
16:45 | 自由討論 |
14) SS研究会HPCフォーラム2008
SS研(Scientific System研究会)のHPCフォーラム2008は、2008年8月27日に汐留の富士通本社の大会議室で「ペタスケール・アプリを支える基盤技術」のテーマで開催された。プログラムは以下の通り。
青柳 睦 (九州大学) | 開会挨拶 |
村上 和彰 (九州大学) | SS研会長あいさつ |
Hans Zima (University of Vienna) | 海外招待講演:High-Productivity Languages for Peta-scale Computing [写真は講演するHans Zima教授。SS研の記録から] |
小柳 義夫(工学院大学 ) | アプリケーションとアーキテクチャ |
佐藤 三久(筑波大学) | ペタスケールシステムへの並列プログラミング言語の課題 –並列言語検討会からの中間報告- |
小野 謙二(理化学研究所) | 次世代HPCにおける大規模データの可視化環境 |
追永 勇次(富士通) | 富士通のペタスケールコンピューティングに向けての取り組み |
水本 好彦 (国立天文台) | 閉会あいさつ |
筆者のところに企画委員会の意向を受けて講演依頼にきた富士通のS女史曰く、「これまでのスライドの使い回しではなく」講演して欲しいとのことであった。たしかに、HPCの歴史については、ずいぶんスライドは使い回しているが、そんな「失礼な」ことを要求する講演依頼は初めてであった。この講演では、最先端のHPCは、「汎用」というコンセプトでは設計ができず中途半端なものができてしまう。応用をはっきり意識して設計したほうがよいマシンが出来、実は他の応用でも活躍できる、ということをコンピュータの歴史から「証明」しようとした。計算可能な問題を何でも解くという概念を打ち出したのはTuring Machineであるが、実際に汎用のマシンを売り出したのはIBM社のSystem/360、つまりメインフレームであった。われわれはメインフレームの「汎用」の亡霊にいまだつきまとわれている、というのが私の主張であった。
15) 第2回先端的大規模計算シミュレ-ションプログラム利用シンポジウム
文部科学省先端研究施設共用イノベーション創出事業の支援を受けて、全国共同利用施設であるスーパーコンピュータを有する7大学は、社会貢献の一環として、大学で開発された応用ソフトウェアとスーパーコンピュータの民間企業への提供を平成19年7月より開始している。本取り組みによる課題の成果報告と、現在の採択課題の中間報告を口頭発表、ポスター発表にて行うシンポジウムが、2008年10月17日東京大学武田先端知ビルで開催された。プログラムの概要は以下の通り。
13:30 | 主催者挨拶、文部科学省挨拶 | |
14:00 | 宮地英生(ケイ・ジー・ティー) | 大規模計算結果の遠隔可視化システムに関する技術開発と実証試験 |
皐月浩史(三菱重工業) | タービン高効率設計に向けた数値タービンの実用 | |
岡本穏治(日本電気) | 固体高分子型燃料電池材料のin silico設計 | |
15:20 | 皆川康久(住友ゴム工業) | フィラー入りゴムの大規模MDシミュレーション |
崎山一幸(パナソニック) | 大規模EMCシミュレーション | |
志水隆一(バイオグリッドセンター関西) | 創薬バリューチェインにおける先端的大規模計算シミュレーションプログラム利用 | |
16:30 | ポスター発表(13社) | |
17:30 | 懇親会 |
16) IPAB
特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ (IPAB)は、2008年5月16日に、秋山泰理事長、小西史一副理事長を選出した。
2008年10月16日~17日に、恵比寿のSGIホールで第9回IPABシンポジウム(IPAB2008 / AheDD2008 合同シンポジウム)~創薬・ゲノム・医療情報処理のアクセラレーション~ を開催した。プログラムは以下の通り。
10月16日 “IPABの新展開”
10:00 | 秋山泰(IPAB理事長 / 東工大) | 開会のご挨拶 |
10:05 | 佐貫俊幸(日本IBM) | ペタ・スケール・コンピューティングに向けての挑戦 |
10:35 | 田村陽介(フィックスターズ) | Cell/B.E.におけるソフトウェア開発の現状と応用事例 |
11:05 | 橋本昌嗣(日本SGI) | GPUコンピューティングの可能性 |
11:35 | 小西史一(東工大) | IPABにおけるアクセラレータWG活動の紹介 |
11:45 | 昼休み、企業展示、学術ポスター展示 | |
13:00 | 萩原兼一(大阪大学) | 特別講演: GPGPUによる医用画像処理について |
13:50 | 日紫喜光良(東邦大学) | IPABにおける医療情報学への取り組み |
14:20 | 鈴木 穣(東京大学) | 次世代シークエンサーを用いた完全長cDNAの解析 |
14:50 | 水島 洋(東京医科歯科大学) | 診療情報と分子情報の網羅的データベース(iCOD)の構築 |
15:20 | コーヒーブレーク、企業展示、学術ポスター展示 | |
16:00 | Prof. Kyoung Tai No (Yonsei University) | Development of e-Organ and It’s Application for Drug Repositioning |
16:30 | 広川貴次(産総研) | 活性部位形状フィンガープリントを用いたバーチャルスクリーニング |
17:00 | Prof. Weiliang Zhu (DDDC, SIMM, China) | Exploring Functional Conformations of Target Protein for Drug Discovery by Molecular Dynamics |
18:00 | 懇親会 |
10月17日 “Asia Hub for e-Drug Discovery”
10:30 | AheDDプロジェクトの紹介 | |
10:45 | Dr. Sungchul Chung (STEPI, Korea) | Opportunities for S&T Cooperation in East Asia |
11:15 | Prof. Yun Tang (ECUST, China) | New potential inhibitor binding sites identified in HIV-1 integrase |
11:45 | Dr. Tohru Natsume (BIRC, AIST, Japan) | Systematic Analysis of Protein Interaction Networks |
12:15 | 昼休み、企業展示、学術ポスター展示 | |
13:30 | Prof. Toshihisa Ishikawa (Tokyo Tech, Japan) | 特別講演:Transporter mechanism-based drug molecular design: High-speed screening, QSAR analysis, and molecular orbital calculation |
14:20 | Prof. Hong Gil Nam (POSTECH, Korea) | Molecule-Level Imaging of Pax6 mRNA Distribution in Mouse Embryonic Neocortex by Molecular Interaction Force Microscopy |
14:50 | Prof. Baik Lin Seong (Yonsei University, Korea) | Common Vaccine Platform for Seasonal and Pandemic Influenza |
15:20 | Dr. Tomoko Niwa (Nippon Shinyaku Co., Ltd., Japan) | Elucidation of Characteristic Structural Features of Protein Kinases: A Neural Network Approach |
15:50 | ポスター発表、コーヒー | |
16:30 | Prof. Jianfeng Pei (Peking University, China) | De novo drug design – to be a more practical approach |
17:00 | Dr. Kunqian Yu (DDDC, SIMM, China) | Drug discovery Grid of China |
17:30 | Dr. Toshio Watanabe (RICS, AIST, Japan) | Molecular Orbital Calculation for Large Molecule with Sakurai-Sugiura Method on Grid Computing Environment |
18:00 | 閉会の辞 |
2008年12月5日には東京工業大学大岡山キャンパスで、IPABオープンセミナー「HPCの動向と将来」を開催した。プログラムは以下の通り、
15:00 | 秋山 泰 IPAB理事長 | ご挨拶とIPAB紹介 |
15:10 | 小柳 義夫(工学院大学) | SC08報告 |
16:00 | 休憩 | |
16:10 | 朴 泰祐(筑波大学) | HPCの動向と将来 |
17:00 | 松岡 聡(東京工業大学) | 最新TSUBAMEシステム |
18:30 | 懇親会 |
17) IC2008
第13回目となるIC2008(インターネットコンファレンス2008)は、2008年10月23日~24日に情報通信研究機構 沖縄亜熱帯計測技術センターにおいて開催された。主催は、電子情報通信学会インターネットアーキテクチャ研究会 (IA)、財団法人インターネット協会 (Iajapan)、日本学術振興会産学協力研究委員会インターネット技術第163委員会 (ITRC)、日本ソフトウェア科学会インターネットテクノロジー研究会 (ITECH)、情報処理学会ハイパフォーマンスコンピューテング研究会 (HPC)、日本UNIXユーザ会 (jus)、WIDEプロジェクト (WIDE)である。プログラム委員長は石山政浩 (東芝)と宇多仁 (北陸先端科学技術大学院大学)、実行委員長は衛藤将史 (情報通信研究機構)である。特別講演「NICT沖縄亜熱帯計測技術センターの紹介」が佐竹誠センター長により行われた。
18) 講演会「Fortran規格最前線 特にcoarrayについて」
11月14日、東京大学一条ホールにおいて、ISO Fortran委員会の議長であるJ.K.ReidがFortran2008の目玉機能である coarrayについて講演を行った。これは、11月16日(日)から21日(金)に東京で国際会議 ISO/IEC JTC 1/SC 22/WG 5 (Fortran)が開催される機会に企画されたものである。プログラムの概略は以下の通り。
13:30 | 高田正之(江戸川大学 ) | Fortran 2003+2008 概略 |
14:00 | SC22/WG5(Fortran) Convener, John K. Reid | Coarrays in Fortran |
15:45 | 佐藤周行(東京大学 ) | Alternatives for Parallelism |
16:15 | Discussions: Advantages for Programmers? Or Burdens for Implementers? |
19) 第9回テラフロップ・ワークショップ(9th Teraflop Workshop)
東北大学サイバーサイエンスセンターと大学院情報科学研究科はドイツのStuttgart大学HLRS (High Performance Computing Center Stuttgart)と共催で、11月12日(水)~13日(木)の両日、東北大学サイバーサイエンスセンターにおいて「計算科学の可能性と次世代スーパーコンピュータ研究開発動向を探る ~ペタスケールコンピューティングへの挑戦~」をテーマに、第9回テラフロップ・ワークショップ(9th Teraflop Workshop)を開催した。主要な招待講演は以下の通り。
Michael Resch(HLRS所長) | Strategies for future hybrid HPC systems |
南 一生(理化学研究所) | Introduction of Applications for High Performance Computing in Japan |
板倉 憲一(JAMSTEC) | System Architecture and Performance Prediction of the Earth Simulator 2 |
高橋 桂子(JAMSTEC) | Seamless Simulations in Climate Variability and HPC |
長友 英夫(大阪大学) | Multi-scale simulations for laser plasma physic |
東田 学(大阪大学) | The Grid Middleware on SX and its Operation for Nation-wide Service |
山田 知典(原研) | Construction of Vibration Table in an Extended World for Safety Assessment of Nuclear Power Plants |
Stefan Wippermann (University of Paderborn) | Large-scale numerical calculations for understanding the physics of materials |
20) 低消費電力マルチコア・シンポジウム
早稲田大学IT 研究機構アドバンストチップマルチプロセッサ研究所は、2008年11月14日、早稲田大学理工学術院55N 号館において、「低消費電力マルチコア・シンポジウム—情報家電用マルチコアチップ・コンパイラ・API—」を開催した。プログラムは以下の通り。
3:00 | ご挨拶 | |
3:05 | 笠原博徳(早稲田大学 ) | リアルタイム情報家電用マルチコア・アーキテクチャ・コンパイラ・API |
3:25 | 木村啓二(早稲田大学 ) | リアルタイム情報家電マルチコア用OSCAR AP |
3:50 | 伊藤雅之(ルネサス テクノロジ ) | 低消費電力情報家電用マルチコア:RP1, RP |
4:10 | 佐藤真琴(日立製作所) | マルチコアAPI 解釈コンパイラの開発 |
4:30 | 休憩 | |
4:40 | 前田誠司(東芝 ) | SpursEngine のアーキテクチャとその狙い |
5:00 | 枝廣正人(日本電気) | 低消費電力マルチコアMPCore とソフトウェア技術 |
5:20 | 木村浩三(パナソニック) | UniPhier プラットフォームにおけるマルチプロセッサ |
5:40 | 鈴木貴久(富士通研究所) | 低消費電力FR1000 マルチコアプロセッサ |
6:15 | (株)東芝, 日本電気(株), パナソニック(株),(株)日立製作所,(株)富士通研究所,(株)ルネサス テクノロジ, 早稲田大学によるデモ | <マルチコア・チップ・コンパイラ・API デモ及び懇親会>(軽食) |
21) 第8回PCクラスタシンポジウム
PCクラスタコンソーシアムは、2008年12月11日~12日、秋葉原コンベンションホールにおいて、「PCクラスタが拓くハイパフォーマンスコンピューティングの世界」をテーマに、第8回PCクラスタシンポジウムを開催した。プログラムは以下の通り。
12月11日
10:00 | 石川裕(PC クラスタコンソーシアム) | オープニング |
10:10 | 堀敦史(PC クラスタコンソーシアム) | Score6 から Score7 へ |
10:50 | 原田浩(PCクラスタコンソーシアム/日本ヒューレット・パッカード) | Score7 入門 |
11:40 | 昼休み | |
13:30 | 高木利久(ライフサイエンス統合データベースセンター) | 招待講演:データベースから眺めるバイオインフォマティクスの新潮流 |
14:30 | 石川裕(東京大学) | MPI規格化最前線 |
15:00 | 休憩 | |
15:30 | 司会:住元 真司(富士通研究所) | パネル討論:大規模クラスタ向け高性能ファイルシステムはかくあるべし |
12月12日
10:00 | 石川裕(PC クラスタコンソーシアム) | PCクラスタコンソーシアム紹介 |
10:15 | 緒方 正人(三菱プレシジョン) | 招待講演:実時間シミュレーションを目指して |
11:00 | インテル/日本AMD/マイクロソフト | PCクラスタプラットフォームの動向 |
12:20 | 昼休み | |
13:30 | アックス/日本電気/日本ヒューレット・パッカード/日立製作所/富士通/ベストシステムズ | メンバ企業によるPCクラスタへの取り組み |
15:00 | 休憩 | |
15:30 | 司会:姫野龍太郎(理研) | パネル討論: オープンスパコンの次にくるもの |
17:30 | 懇親会 |
次は会議以外の国内のアカデミアの動き。2008年6月2日にT2Kスーパーコンピュータは正式に稼動を開始した。TSUBAMEも進化していく。
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