【遺伝研】スーパーコンピュータシステム 【入札締切 9/11】

機関名

情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所

件名

スーパーコンピュータシステム

調達方式

借入

借入期間

平成31年3月1日から平成36年2月29日

これまでの流れ

主な仕様(資料招請時)

Ａ　　本システムは、分散記憶型並列計算機を構成する計算ノード、大容量高速ストレージシステム、およびこれらを接続するノード間相互接合網、停電対策のためのUPS装置、空調装置などからなる。伝統的ジョブスケジューリングシステムによる管理に加えてApache Mesosを用いたビッグデータ解析基盤を構築する。個人ゲノムの管理に適したセキュリティーシステムの提案を歓迎する。
Ｂ　　設置場所は遺伝研電子計算機棟２F及び３F計算機室とする。３Fは空調機の入れ替えが必要である。また、物理セキュリティ強化のための設備工事が必要である。提案者は施設説明会（日程は導入説明会にて説明）により現地を確認し適切な方法を提案すること。
Ｃ　　計算ノードはCPUソケット数、主記憶容量などが異なる２種類の計算ノード(Thin,Medium)から構成される。計算ノード内のすべてのCPUはx86_64の命令体系を有すること。
Ｄ　　本システムはそれぞれ２基以上のCPUを搭載した384台のThin計算ノードを備えること。Thin計算ノードはCPUソケットあたり６以上のメモリチャネルを有し、CPUソケットあたり256 GB以上のメモリを搭載すること。384台のThin計算ノードのうち128台についてはそれぞれの計算ノードの倍精度演算ピーク性能は合算で2,048 GFLOPS以上であること。残り256台のThin計算ノードについてはCPU単体の倍精度演算ピーク性能は512 GFLOPS以上、Thin計算ノードのSPECint_rate_base2006が1,840以上であること。この256台のThin計算ノードのうちの128台については、それぞれ４ TB以上のSSDをNVMeポートに搭載すること。
Ｅ　　Medium計算ノードはノードあたり６TB以上のCPUメモリを持つこと。初回導入時10ノード以上で構成すること。
Ｆ　　各Thin計算ノード及びMedium計算ノードはノード間相互接合網に対して40 Gbps以上の帯域幅で接続すること。
Ｇ　　大容量高速ストレージシステムは、非フォーマット時で15 PB以上の物理容量を有すること。高速かつ高信頼な並列ファイルシステムを有すること。
Ｈ　　本スーパーコンピュータシステムのノード間相互接合網はファイアウォール装置を介して10GbE×４で外部ネットワーク(SINET5)に接続すること。

現在のシステムについて

スーパーコンピュータシステム

関連リンク

国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム