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記事寄稿について
8月 6, 2019
【遺伝研】遺伝研スーパーコンピュータシステム計算ノード増設 【入札締切 9/30】
機関名
国立遺伝学研究所
件名
遺伝研スーパーコンピュータシステム計算ノード増設
調達方式
購入
納入期限
2020年3月31日
これまでの流れ
| 手続き | 公示日 | 説明会開催日 | 締切日 |
| 入札 | 2019/8/6 | 2019/8/22 14:30 国立遺伝学研究所本館2階会議室 |
入札:2019/9/30 17:15 開札: 2019/11/29 14:00 |
| 意見招請 | |||
| 資料招請 | 2019/3/1 | 2019/3/11 14:00 国立遺伝学研究所本館２階会議室 | 2019/4/11 17:15 |
主な仕様(資料招請時)
- A．本システムは80台以上の計算ノードおよびその冷却システムからなること。計算ノードはそれぞれ２基以上のCPUを搭載すること。計算ノードの半数はCPUソケットあたり８以上のメモリチャンネルを持ちCPUソケットあたり256GB以上のメモリを備えること。CPUあたり64コア以上とし倍精度浮動小数点演算ピーク性能は2,150GFLOPS以上であること。計算ノードの残り半数はCPUソケットあたり６以上のメモリチャンネルを持ちCPUソケットあたり96GB以上のメモリを備えること。CPUあたり16コア以上としCPUあたりの倍精度浮動小数点演算ピーク性能は1024GFLOPSであること。計算ノード内のすべてのCPUは x86_64の命令体系を有すること。
- B．本システムは４基のInfiniBand ４×EDRスイッチを有すること。上記の計算ノードは既設の遺伝研スーパーコンピュータのノード間相互結合網を構成する８基のスパインスイッチに対してこの４基のリーフスイッチを介して接続すること。それぞれのスパインスイッチとそれぞれのリーフスイッチの間の理論バンド幅は100Gbps以上であること。それぞれの計算ノードは既設遺伝研スーパーコンピュータの大容量高速ストレージシステムおよび大容量アーカイブシステムをマウント可能であること。
- C．計算ノード設置場所は遺伝研電子計算機棟 ２F とする。物理セキュリティ強化のため、侵入防止設備工事の導入を検討している。
現在のシステムについて
スーパーコンピュータシステム
| システム | 不明 |
| 主契約者 | 株式会社日立製作所 |
| 契約金額 | 2,499,984,000円 |
| 調達方式 | 借入 |
| 落札日 | H30/10/25 |
| 備考 | 借入期間:平成27年7月1日から平成32年6月30日 |
関連リンク
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寄稿者
西克也
西克也はフェアチャイルド社、クレイ・リサーチ社、ベストシステムズ社など、30年以上に渡ってHPCに関する仕事に従事している。Hpcwire Japanの編集長として記事の作成と翻訳を行っている。
島田佳代子
1999年～2007年まで英国在住。2001年よりスポーツ、旅、ビジネス、映画など幅広いジャンルで執筆活動を開始し、Hpcwire Japanでは主に日本のHPC業界が世界に誇る研究者、開発者の方々のインタビューを担当。
小柳義夫
小柳義夫氏は40年以上に亘ってHPCに携わってきた研究者であり、日本のHPC業界における生き字引として有名。現在 高度情報科学技術研究機構に所属し、産業界のHPC推進にあたっている。
小西史一
小西史一は、理化学研究所、東京工業大学においてHPCおよびバイオインフォマティクスに関する研究と教育に携わってきた研究者。2012年からフォトグラファーとしての活動を開始し、現在はIT技術・セキュリティのコンサルティング業務に携わっている。