【国立遺伝学研究所】スーパーコンピュータシステム 【資料締切 11/17】

機関名

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所

件名

スーパーコンピュータシステム

調達方式

借入

導入予定時期

令和6年度3月以降

これまでの流れ

主な仕様(資料招請時)

Ａ　本システムは、分散記憶型並列計算機を構成する計算ノード、大容量高速ストレージシステム、およびこれらを接続するノード間相互接合網、停電対策のためのＵＰＳ装置、空調装置などからなる。伝統的ジョブスケジューリングシステムによる管理に加えてKubernetesを用いたビッグデータ解析基盤を構築する。個人ゲノムの管理に適したセキュリティーシステムの提案を歓迎する。
Ｂ　設置場所は遺伝研電子計算機棟２Ｆ及び３Ｆ計算機室とする。２Ｆは空調機の導入が必要である。
Ｃ　計算ノードは構成が異なる３種類の計算ノード（ＨＰＣ　ＣＰＵ最適化ノード、アクセラレータ最適化ノード、メモリ最適化ノード）から構成される。計算ノード内のすべてのＣＰＵはx86_64の命令体系を有すること。
Ｄ　ＨＰＣ　ＣＰＵ最適化ノードは全体の合計で11,200ＣＰＵコアを有すること。１ノード当たり112ＣＰＵコア以上を有し１ノード当たりの倍精度浮動小数点演算ピーク性能は6.3ＴＦＬＯＰＳ以上であること。ＣＰＵソケットあたり８以上のメモリチャネルを有し、ＣＰＵコアあたり８ＧＢ以上のＥＣＣ機能付きメモリを搭載すること。ノード内にＯＳ領域用に480ＧＢ以上、データ領域用に960ＧＢ以上のNVMe SSDを搭載すること。1.92ＴＢ以上であるとさらに望ましい。
Ｅ　アクセラレータ最適化ノードは全体で16台以上のノードから構成され、合計120基以上のＧＰＵアクセラレータが装着されていること。200基以上であるとさらに望ましい。ＧＰＵアクセラレータの性能は、チップあたりの単精度浮動小数点演算のピーク性能が67ＴＦＬＯＰＳ以上、倍精度のピーク性能が34ＴＦＬＯＰＳ以上であること。ＧＰＵアクセラレータは、ＣＵＤＡによりプログラミングされたプログラムにより利用可能であること。各ノード内にＯＳ領域用に480ＧＢ、データ領域用に960ＧＢ以上のNVMe SSDを搭載すること。1.92ＴＢ以上であるとさらに望ましい。
Ｆ　メモリ最適化ノードは各ノード192コア以上のx86_64ＣＰＵコアを搭載すること。メモリ最適化ノード全体の合計として1920コア以上を備えること。１ノード当たりの倍精度浮動小数点演算ピーク性能は12.6ＴＦＬＯＰＳ以上であること。ノードあたり６ＴＢ以上のメモリを搭載すること。ノード内にＯＳ領域用に480ＧＢ以上、データ領域用に960ＧＢ以上のNVMe SSDを搭載すること。1.92ＴＢ以上であるとさらに望ましい。
Ｇ　大容量高速ストレージシステムはＲＡＩＤ６相当の冗長化構成を行った際のＯＳ認識時に合計で50ＰＢ以上を有すること。計算ノードからはノード間相互結合網を通じてアクセスすること。大容量高速ストレージシステムは15ＰＢ以上、15ＰＢ以上、20ＰＢ以上の領域を持つ３つの独立なファイルシステムとして構成すること。
Ｈ　各ノードおよび高速ストレージシステムはノード間相互接合網に対して200Gbps以上の理論帯域幅で接続すること。
Ｉ　本スーパーコンピュータシステムのノード間相互接合網はファイアウォール装置を介して100Gbpsで外部ネットワーク（ＳＩＮＥＴ６）に接続すること。

これまでのシステム調達結果

関連リンク

遺伝研スーパーコンピュータシステム