【京都大学化学研究所】スーパーコンピュータシステム 【入札締切 6/26】

機関名

京都大学化学研究所

件名

スーパーコンピュータシステム

調達方式

借入

借入期間

平成32年1月1日から平成35年12月31日

これまでの流れ

主な仕様(資料招請時)

Ａ　　今回導入予定のスーパーコンピュータシステムは、現在使用しているスーパーコンピュータシステムを次世代の計算化学・ゲノム科学に対応すべく拡張するものであり、以下の構成を要する。システムはゲノムネット計算サーバ、化学計算サーバ、ログインサーバ、ゲノムネット公開サーバ、ゲノムネット開発サーバ、開発基盤サーバ、情報基盤サーバ、システム管理サーバからなる８つのサーバ群と、高速アクセス用分散ファイルシステム、大容量ネットワークファイルシステムからなる２つのネットワークディスク装置、ディザスターリカバリー用バックアップストレージ、ネットワーク装置、無停電電源装置、冷却設備で構成される。システムはLinux環境で運用され、以下に示す全ての要件を満たす。
Ｂ　　ゲノムネット計算サーバは、２ノード以上からなるシステムAと100ノード以上からなるシステムBで構成される。
  ａ　 システムAの各ノードは、理論演算性能は67.5TFLOPS 以上であり、共有メモリ方式で24TiB以上の主記憶容量を備えていること。また、NVM Express規格のSSDを50TB以上有すること。
  ｂ　 システムBの各ノードは、40以上のCPUコアを有し、理論演算性能が 3.32TFLOPS 以上であること。768GiB 以上の主記憶容量を備えていること。
  ｃ　 システムA、B ともに、計算生物学関連、特にゲノム解析関連のソフトウェアが整備されていること。
Ｃ　　化学計算サーバは、66ノード以上からなるシステムAと18ノード以上からなるシステムBで構成される。
  ａ　 システムA、Bの各ノードは、40以上のCPUコアを有し、理論演算性能が 3.32TFLOPS 以上であること。768GiB以上の主記憶容量を備えていること。
  ｂ　 システムBの各ノードは、GPUを２式以上備えていること。
  ｃ　 システムA、B ともに、計算化学関連のソフトウェアが整備されていること。
Ｄ　　ログインサーバは３ノード以上からなり、１ノードあたりの構成は化学計算サーバのシステムBと同一であること。
Ｅ　　ゲノムネット公開サーバは６ノード以上からなり、各ノードは64以上のCPUコアを有し、768GiB以上の主記憶容量を備えていること。
Ｆ　　ゲノムネット開発サーバは４ノード以上からなり、各ノードは64以上のCPUコアを有し、1.5TiB以上の主記憶容量を備えていること。
Ｇ　　開発基盤サーバは５ノード以上で構成される。
  ａ　 32以上のCPUコアを有し、1.5TiB以上の主記憶容量を有するノードを１ノード以上備えること。
  ｂ　 16以上のCPUコアを有し、192GiB以上の主記憶容量を有するノードを２ノード以上備えること。各コアは3.5GHz以上で動作すること。リレーショナルデータベースシステムを提供すること。
  ｃ　 32以上のCPUコアを有し、384GiB以上の主記憶容量を有するノードを２ノード以上備えること。
Ｈ　　情報基盤サーバは９ノード以上で構成される。
  ａ　 32以上のCPUコアを有し、192GiB以上の主記憶容量を有するノードを３ノード以上備えること。
  ｂ　 32以上のCPUコアを有し、384GiB以上の主記憶容量を有するノードを６ノード以上備えること。ネームサーバ、メールサーバ、ウェブサーバとしての機能を備えること。
Ｉ　　システム管理サーバは３ノード以上からなり、各ノードは32以上のCPUコアを有し、96GiB以上の主記憶容量を備えていること。
Ｊ　　ネットワークディスク装置は、12PB 以上の大容量ネットワークファイルシステムと10PB以上の高速アクセス用分散ファイルシステムからなること。
Ｋ　　ゲノムネット計算サーバのシステムA、ログインサーバ、ゲノムネット公開サーバ、ゲノムネット開発サーバ、開発基盤サーバ、情報基盤サーバ、システム管理サーバは、10Gbps以上の高速ネットワークでサーバ接続用ネットワークを構成すること。サーバ接続用ネットワークはファイアウォールを介して学内LAN (KUINS)及びSINETに接続すること。また、外部からのアクセス用にVPN装置を備えること。
Ｌ　　ゲノムネット計算サーバ、化学計算サーバ、ログインサーバ、ゲノムネット公開サーバ、ゲノムネット開発サーバ、開発基盤サーバ、情報基盤サーバ、システム管理サーバ及び大容量ネットワークファイルシステムは10Gbps以上の高速ネットワークでNAS接続ネットワークを構成すること。
Ｍ　　ゲノムネット計算サーバ、化学計算サーバ、ログインサーバ、ゲノムネット公開サーバ、ゲノムネット開発サーバ、開発基盤サーバ、システム管理サーバ及び高速アクセス用分散ファイルシステムを100Gbps以上のネットワークで接続すること。
Ｎ　　８つのサーバ群と２つのネットワークディスク装置、ネットワーク装置は無停電電源装置に接続されており、５分程度の瞬間停電時にもシステムの継続運用が可能であること。
Ｏ　　システムを安定稼働するために十分な冷却能力を備えること。消費電力を抑制するための対策を講じること。
Ｐ　　ディザスターリカバリー用バックアップストレージとして500TB以上を備えること。
Ｑ　　ディザスターリカバリー用バックアップストレージ専用の無停電電源装置を備え、５分程度の瞬間停電時にもシステムの継続運用が可能であること。
Ｒ　　講習会用のノートＰＣを30台備えること

現在のシステムについて

スーパーコンピュータシステム

関連リンク

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